办理食品加工厂需要以下手续：
办理营业执照
办理营业执照是取得合法主体资格，进行经营的前提条件。需要向当地工商局提交申请，并按照规定提交相关材料，如公司章程、股东身份证明等。
申请食品生产许可证（QS证）
只有取得食品生产许可证后，才能进行食品生产。需要向当地的质监局提交申请，并满足一定的条件，如生产厂房、设备、卫生条件等。质监局会对申请资料进行审核，并进行现场核查，最终发放食品生产许可证。
办理食品流通许可证
如果食品加工厂涉及食品流通环节，还需要办理食品流通许可证。这个许可证需要在当地所属辖区的工商局办理，提交相关材料如租赁合同、经营场所布局图等。
办理卫生许可证
食品加工厂需要办理卫生许可证，以证明其生产环境符合卫生标准。需要向当地卫生局提交申请，并经过卫生监督员现场审查，符合要求后由卫生局审批并发放卫生许可证。
办理健康证
食品加工厂的从业人员需要办理健康证，以证明其身体健康，符合食品生产的要求。需要到当地疾控中心或指定医院进行体检并办理健康证。
消防相关手续
食品加工厂需要符合消防安全要求，可能需要办理相关的消防手续，如消防验收合格证明等。
税务登记
在取得营业执照后，还需要到税务局进行税务登记，开设公司银行账户，并依法纳税。
其他可能的手续
根据具体的经营内容和地区要求，可能还需要办理其他手续，如环保手续、特种设备使用许可证等。
以上是办理食品加工厂的基本手续，具体要求可能因地区和行业而异，建议在具体办理前咨询当地相关部门或专业机构，以确保手续齐全、合法。