腔肠动物和扁形动物是两种不同的无脊椎动物，它们在多个方面存在显著差异：
身体结构
腔肠动物：身体呈辐射对称，体壁由2个胚层构成，体表有刺细胞，有口无肛门。例如，水螅的身体结构辐射对称，便于从各个方向捕获猎物和进行防御。
扁形动物：身体呈两侧对称，背腹扁平，有口无肛门。例如，涡虫的身体背腹扁平，前端具有眼点，便于感知外界刺激和进行定向运动。
消化系统
腔肠动物：具有胃腔消化系统，食物通过胃腔消化吸收，无真正的体腔。例如，水螅的消化腔由内胚层构成，与口相通，食物残渣由口排出。
扁形动物：具有原始的消化系统，食物通过肠道消化吸收，同样无真正的体腔。例如，涡虫的口中有咽，食物在肠内消化，消化后的食物残渣由口排出。
循环系统
腔肠动物：没有真正的循环系统，海水直接通过体壁进行交换。例如，水螅没有专门的循环系统，依靠体壁进行物质的交换。
扁形动物：具有简单的循环系统，血液在血管内流动。例如，涡虫的血液在血管内流动，通过专门的运动器官进行定向运动。
神经系统
腔肠动物：具有弥散型神经系统，神经细胞分布在身体各处。例如，水螅的神经细胞分布在身体各处，使其能够感知周围环境的刺激并进行防御。
扁形动物：具有简单的神经系统，由神经细胞和神经索组成。例如，涡虫的神经系统由神经细胞和神经索构成，使其能够感知外界刺激并进行定向运动。
生殖系统
腔肠动物：具有复杂的生殖系统，雌雄异体。例如，水螅通过出芽方式进行生殖，利用芽体进行繁殖。
扁形动物：生殖器官特别发达，多数为雌雄同体或异体。例如，涡虫和一些绦虫具有特别发达的生殖器官，多数扁形动物营寄生生活。
生活环境
腔肠动物：大多生活在海洋中，少数种类生活在淡水中。例如，水螅通常生活在水流缓慢、水草繁茂的清洁淡水中。
扁形动物：既有自由生活的种类，如涡虫，也有寄生在人和动物体内的种类。例如，华枝睾吸虫、猪肉绦虫和血吸虫等常见的人体寄生虫。
总结：
腔肠动物和扁形动物在身体结构、消化系统、循环系统、神经系统、生殖系统和生活环境等方面均有显著差异。腔肠动物主要生活在水中，具有辐射对称的身体结构和复杂的生殖系统；而扁形动物身体呈两侧对称，背腹扁平，多数种类为寄生生活，具有简单的消化系统和循环系统。