当前我国政府机构改革面临的问题主要包括以下几个方面：
传统行政观念的影响：
传统行政观念对行政人员的影响难以转变，导致改革阻力较大。
体制机制不完善：
与机构改革相配套的体制机制尚不完善，影响改革的整体效果。
行政权力改革滞后：
行政权力改革滞后，导致机构改革动力不足。
机构改革方案一刀切：
机构改革方案缺乏针对性，改革效果不显著。
职责划分不明确：
各部门间职能职责交叉或缺失，导致协调难度大，影响工作顺利开展。
改革不彻底：
上一轮机构改革在一些地区和领域仍不彻底，存在“一刀切”现象。
职务职级并行问题：
职务职级并行实施过程中出现走样变形，成为解决个人待遇的福利渠道。
政策不透明：
乡镇机构改革中政策执行细节不明确，影响改革顺利进行。
财政和人力资源问题：
乡镇机构改革面临财政投入不足和人力资源缺乏的问题。
利益分配问题：
改革涉及利益关系调整，利益分配复杂且矛盾重重。
基层治理治理能力不足：
基层治理能力不足，影响改革推进。
职责同构问题：
政府“双重管理”体制导致职责同构，形成改革的外在刚性制约。
领导职数超编：
领导职数已超编，导致人员安排和晋升困难。
副职交流不畅：
副职多年未交流，影响工作积极性和组织活力。
资深职工管理难题：
资深职工不服管，影响工作效率和管理秩序。
观念更新困难：
机构改革观念更新困难，政府职能转变不彻底。
利益关系调整：
科学布局和利益关系调整难度大，影响改革进程。
机构消肿和人员分流：
机构消肿和人员分流存在诸多困难，影响改革效果。
综上所述，当前我国政府机构改革面临多方面的问题和挑战，需要综合考虑历史经验和现实情况，制定科学合理的改革方案，并加强政策宣传和执行力度，以确保改革能够取得实质性进展。