归档文件整理规则遵循以下原则和要求：
遵循文件的形成规律
文件整理应反映文件形成的自然规律，保持文件之间的有机联系。
文件之间的有机联系
文件之间的规律决定了它们之间存在有机联系，这有助于反映职能活动的历史面貌，并为归档后的查找和利用提供便利。
区分不同价值
根据文件的价值，将其划分为不同的保管期限，并分别进行整理归档。
便于保管和利用
这是归档文件整理的最基本原则，也是整理的最终目的。
整理单位
归档文件一般以每份文件为一件。
文件排序
正文在前，附件在后；
正本在前，定稿在后；
转发文在前，被转发文在后；
原件在前，复制件在后；
汉文文本在前，少数民族文字文本在后；
中文本在前，外文本在后；
来文与复文作为一件时，复文在前，来文在后；
有文件处理单或发文稿纸的，文件处理单在前，收文在后；
正本在前，发文稿纸和定稿在后。
排列原则
事由原则：同一事由的相关文件应当排列在一起。
整理步骤
组件、分类、排列、修整、装订、编页、编号、编目、装盒、排架等。
档案分类
根据案件内容、部门组织、业务项目等因素，按部门、大类、小类三级分类。
档号编定
档号应自左而右编列，右方装订的案件，档号填写于案件首页的左上角；左方装订者则填写于右上角。
保存期限
文件保存期限根据文件性质和重要性分为永久保存、10年保存、5年保存和1年保存。
档案清理
定期清理档案，对已到保存期限的文件进行销毁，并对保留的文件进行标记。
整理归档文件时，应确保纸质文件和电子文件整理协调统一，并符合文档一体化管理要求。整理后的文件应齐全完整，破损的文件应修整，字迹模糊的文件应复制，且使用的材料符合档案保护要求。