公司变更代理费用因多种因素而异，包括地区、具体情况（如法人是否占有股份）以及是否涉及股权转让等。以下是一些概括性的费用信息：
基本变更登记费
国家规定的法人变更登记费为100元。
对于特定单位（如国家核拨部分经费的事业单位和科技性社会团体），如果从事经营活动或设立不具备法人条件的企业，变更登记费用为20元。
法人不占股份的情况
变更费用通常为几百元的手续费，具体金额可能在500-1000元人民币范围内，包含代理服务费和基本的行政费用。
法人占有股份的情况
除了基本的变更费用外，还可能涉及股权转让的税费，包括：
印花税：按照注册资金的万分之五收取。
个人所得税：
平转（即没有溢价）：按注册资金的万分之五收费。
差额转（即有溢价）：按注册资金的万分之二十收费。
其他费用
代理服务费：普通变更一般在500-1500元人民币，涉及股权转让的费用一般在2500-5000元人民币。
部门收费（行政费用）：大多数地方的市场监督管理部门已经不收取相关行政费用，但具体政策可能因地区而异。
材料制作费（打印、装订、签字盖章）：一般在几百元人民币，具体取决于材料的数量和质量。
交通住宿费：如果代理公司需要前往客户公司或相关部门办理业务，可能会产生交通和住宿费用，具体费用因距离和标准而异。
建议
详细咨询当地代办机构：由于费用受地区、代理公司知名度和服务质量等因素影响，建议事先咨询当地的具体代办机构和工商、税务部门，以获取最准确的费用信息。
考虑整体成本：除了代理费用外，还需考虑材料制作费、交通住宿费等附加成本，以确保整体预算的合理性。