我国食源性疾病监测存在的问题主要包括以下几个方面：
被动监测模式：
我国食源性疾病监测主要采用被动监测模式，即相关机构和人员报告食源性疾病病例，而不是主动进行监测。
报告不及时：
由于监测模式的被动性，食源性疾病病例的报告往往存在延迟，不能及时反映疾病的发生和流行情况。
漏报率高：
由于报告不及时以及监测覆盖不全等原因，食源性疾病病例的漏报率较高，导致实际发病人数可能远大于已报告的数据。
缺乏特异性：
现有的监测手段和指标在特异性方面存在不足，难以准确诊断食源性疾病的具体原因和病原体。
综上所述，我国食源性疾病监测在被动监测模式、报告不及时、漏报率高和缺乏特异性等方面存在明显问题，需要进一步完善和改进监测系统，提高监测的及时性、准确性和全面性。