进项税额的计算方法如下：
增值税专用发票上的税额
从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额可以直接抵扣。
海关完税凭证上的税额
从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额也可以抵扣。
农产品进项税额
购进农产品时，除了取得增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书外，还可以按照农产品收购发票或销售发票上注明的农产品买价和规定的扣除率计算进项税额。一般农产品的扣除率为13%，但用于深加工的农产品扣除率可能有所不同。
运输费用进项税额
购进或者销售货物以及在生产经营过程中支付的运输费用，可以按照运输费用结算单据上注明的运输费用金额和规定的扣除率计算进项税额。一般运输费用的扣除率为7%，但具体扣除率可能因政策调整而变化。
其他特殊情况
纳税人购进货物或接受应税劳务时，如果没有取得合法的扣税凭证，但符合其他抵扣条件，也可以按照相关规定计算进项税额。
具体计算示例
增值税专用发票
假设企业购进货物，取得增值税专用发票，发票上注明的税额为10万元，则进项税额为10万元。
海关完税凭证
假设企业进口货物，取得海关进口增值税专用缴款书，缴款书上注明的税额为5万元，则进项税额为5万元。
农产品
假设企业购进农产品，取得农产品收购发票，买价为20万元，扣除率为13%，则进项税额为20万元 × 13% = 2.6万元。
运输费用
假设企业支付运输费用10万元，扣除率为7%，则进项税额为10万元 × 7% = 0.7万元。
总结
进项税额的计算涉及多种情况，企业应根据具体业务类型和凭证取得情况，选择合适的公式进行计算。同时，要注意相关政策的更新和调整，以确保计算的准确性和合法性。