水污染防治措施主要包括以下几个方面：
风险管理
对有毒有害水污染物实行风险管理，制定有毒有害水污染物名录。
排放名录中所列有毒有害水污染物的企业事业单位和其他生产经营者，应当对排污口和周边环境进行监测，评估环境风险，排查环境安全隐患，并公开有毒有害水污染物信息，采取有效措施防范环境风险。
严禁排放有害物质
不得向水体排放油类、酸性液体、碱性液体或者剧毒废液。
不得向水体排放、倾倒工业废渣、城镇垃圾和其他废弃物。
禁止在江河、湖泊、运河、渠道、水库最高水位线以下的滩地和岸坡堆放、存贮固体废弃物和其他污染物。
消毒处理污水
含病原体的污水应当经过消毒处理，符合国家有关标准后，方可排放。
综合治理
减少和消除污染源排放的废水量，包括节约生产废水、规定用水定额、改革生产工艺、减少废水排放量、尽量采用重复用水及循环用水系统、控制废水中污染物浓度、回收有用产品、处理好城市垃圾与工业废渣。
全面规划，合理布局，进行区域性综合治理，对水体污染源进行全面规划和综合治理，杜绝工业废水和城市污水任意排放，规定排放标准，将同行业废水集中处理，以减少污染源的数目，便于管理。
加强监测管理，制定法律和控制标准，设立环境保护管理机构，协调和监督各部门和工厂保护水源。
科学保护水资源
提高用水效率，科学保护水资源，推进农业农村污染防治，调整产业结构，优化空间布局。
其他措施
因地制宜地进行各方面的规划设计，采取科学合理的布局，对整个区域采取综合防治措施，优先解决城市和行业开发建设中的水污染问题，预测水污染形势，采取防治措施，严格按照规定的标准，对生活污水、工业污水和废水等污染源进行综合治理，杜绝随意排放。
加强对污染水体的有计划整治，减少和消除污染物的废水排放量，采用改良的工艺来减少甚至不排放废水，或者降低有毒废水的毒性，使用污水处理紫外线消毒器对水体进行消毒，废水回用，控制废水中污染物的浓度，回收有用的产品，处理城市垃圾和工业废渣。
实时监测水质数据变化，定期提升水质，改善水环境问题，在下雨后等关键时期，及时抑制藻类生长，防止水环境问题爆发。
这些措施的实施需要政府、企业和公众的共同努力，通过法律、技术和管理的手段，全面系统地推进水污染防治工作，保护水资源，改善水环境质量。