基建档案整理方法主要包括以下几个步骤：
分类
基建档案通常按照工程项目分类，一个全宗中的基建档案为一级类目，具体基建项目为二级类目，三级类目可根据需要设置。
分类方法可以按各参建单位分类，或按前期准备阶段、设计阶段、施工阶段（工程监理）、竣工验收阶段和使用维护阶段等5个阶段分类。
立卷
基建档案的纸质材料一般可分为管理性文件、施工（监理）基础资料、图纸等。
管理性文件一般按问题组卷；施工（监理）基础资料按材料性质（如质量评定表、隐蔽工程验收记录等）和工程部位或时间顺序组卷；图纸按照图纸目录组卷。
卷内文件整理
卷内文件一般按照文件间的联系、时间顺序、施工顺序排列。
一般的正本在前，底稿在后；批复在前，请示在后；结果在前，过程在后。
有图纸目录的，按图纸的原目录、图号排列；没有图纸目录的，先排总平面布置图，后排局部图。
每卷文件单独编一个流水页码，用号码机打印，单面书写的在右下角打页码，双面书写的正面在右下角、背面在左下角打页码。
填写卷内目录与备考表
科技档案卷内文件目录是登录案卷内文件题名及其他特征并固定文件排列次序的表格，排列在卷内文件材料首页之前。
序号用阿拉伯数字从“1”依次标注卷内科技文件材料件数的顺序。
备考表用于记录卷内文件的情况，如文件是否完整、是否有缺失等。
填写案卷封面
根据档案的分类和立卷情况，填写案卷封面，明确案卷的基本信息，如项目名称、立卷单位、日期、保管期限等。
装订
案卷应装订成册，便于保管和利用。卷内文件材料排列应整齐，封面和封底应平整，案卷厚度一般不超过40mm。
编目
案卷编目是对案卷内文件进行系统排列和著录编目的过程，便于检索和利用。
装盒
将整理好的案卷按照一定的顺序和编号装入档案盒中，便于管理和查找。
建议
在进行基建档案整理时，应严格按照相关标准规范进行操作，确保档案的完整性和准确性。
分类和立卷时要充分考虑文件的形成规律和有机联系，便于后续的保管和利用。
定期对档案进行检查和整理，确保档案的时效性和可用性。