磷酸二酯键的位置如下：
核苷酸内部：
磷酸二酯键位于核苷酸的磷酸基团与五碳糖（戊糖）的第5位碳原子之间。具体来说，一个核苷酸的3号碳原子与下一个核苷酸的5号碳原子之间形成磷酸二酯键。
DNA分子中：
在DNA分子中，磷酸二酯键连接相邻的核苷酸，形成磷酸二酯链。这些键将脱氧核糖与碱基连接起来，构成DNA双螺旋结构的基本骨架。
RNA分子中：
在RNA分子中，磷酸二酯键同样连接相邻的核糖核苷酸，形成RNA链。不过，RNA中的核糖是五碳糖，与DNA中的脱氧核糖不同。
总结：
磷酸二酯键主要位于核苷酸的磷酸基团与五碳糖（戊糖）的第5位碳原子之间，连接形成核苷酸链，在DNA和RNA分子中分别构成其基本骨架。