房地产企业的土地使用税计算方式如下：
计算公式
应纳城镇土地使用税额 = 应税土地的实际占用面积 × 适用单位税额。
税率与缴纳时间
土地使用税采用定额税率，具体标准根据城市规模（大城市、中等城市、小城市、县城、建制镇、工矿区）有所不同。例如，大城市每平方米年税额为1.5元至30元，中等城市为1.2元至24元，小城市为0.9元至18元，县城、建制镇、工矿区为0.6元至12元。
房地产企业一般从土地使用权确定后的第二个月开始缴纳土地使用税，如果土地使用权是通过出让或转让方式有偿取得的，则从合同约定的交付土地时间次月起缴纳。
特殊情况的处理
对于房地产开发企业建造的商品房，在房屋使用或交付之次月起开始计征城镇土地使用税。
如果商品房在销售前已经使用或出租、出借，则应按规定征收房产税。
在项目建成并开始销售的情况下，如果公共设施在销售结束后归业主所有，则按项目总可售建筑面积占可售单元总占地面积的比例计算每个可售单元应分摊的土地面积，并据此计算当月应税土地面积。
建议
房地产企业在计算土地使用税时，应严格按照当地规定的税率和缴纳时间进行申报和缴纳，确保合法合规。
对于分期开发的项目，应注意土地使用税的计算和缴纳时间，避免因未按时缴纳而产生不必要的罚款和滞纳金。
在项目销售过程中，应根据实际情况调整应税土地面积，确保税额计算的准确性。