卫生许可证和食品经营许可证的区别主要体现在以下几个方面：
颁发部门不同
卫生许可证：由卫生健康行政部门颁发，用于证明某一单位或个人在卫生条件、卫生管理等方面符合国家规定的证书。
食品经营许可证：由市场监督管理部门颁发，用于证明食品生产经营者在食品安全管理方面符合国家标准的证书。
适用范围不同
卫生许可证：适用于公共场所、餐饮服务、食品生产等行业，主要监管公共卫生安全，包括环境卫生、食品卫生等。
食品经营许可证：主要适用于食品生产、流通、销售环节，重点监管食品安全，包括食品质量、添加剂使用等。
监管重点不同
卫生许可证：侧重于公共场所的卫生条件，如旅店、餐馆、美容美发店等的卫生管理。
食品经营许可证：侧重于食品的安全和质量，包括食品生产加工企业、餐饮服务单位、食品销售商等的食品安全管理制度的建立和执行。
办理条件不同
卫生许可证：需要满足公共卫生要求，包括卫生管理制度、从业人员健康证明、场所平面图等。
食品经营许可证：需要提交营业执照副本、食品安全管理制度、食品原料来源证明、从业人员健康证明等。
有效期限不同
卫生许可证：通常没有明确的有效期限，但需要定期进行复审。
食品经营许可证：一般有效期为5年，需要在每个有效期届满前进行延续。
法律依据不同
卫生许可证：依据《公共场所卫生管理条例》等，关注卫生标准、污染源的距离、消毒设施等。
食品经营许可证：依据《中华人民共和国食品安全法》和《食品经营许可管理办法》，涉及食品销售和餐饮服务的许可程序和要求。
需要注意的是，根据最新的《食品经营许可证》颁发制度，原来的《食品流通许可证》、《餐饮服务许可证》以及《卫生许可证》实行三证合一，即经营者仅需办理《食品经营许可证》即可。
综上所述，卫生许可证和食品经营许可证虽然都与食品安全和卫生相关，但它们在颁发部门、适用范围、监管重点、办理条件和法律依据等方面存在明显的区别。