西南科技大学的王牌专业包括：
材料科学与工程
自动化
环境工程
农学
地质工程
光信息科学与技术
生物化学与分子生物学
机械设计制造及其自动化
电子信息工程
应用化学
计算机科学与技术
软件工程
工商管理
经济学
土木工程
无机非金属材料工程
工程力学
工业工程
建筑环境与设备工程
电气工程及其自动化
医学影像技术
这些专业中，材料科学与工程、自动化、环境工程、农学、地质工程、光信息科学与技术、生物化学与分子生物学等被认定为国家级特色专业建设点。此外，机械设计制造及其自动化、电子信息工程、应用化学、计算机科学与技术、软件工程、工商管理、经济学等也被视为学校的王牌专业。
建议学生在选择专业时，可以优先考虑这些王牌专业，因为它们不仅拥有优秀的师资力量和实验室设备，而且毕业生就业前景广阔，深受学生和社会的认可。