合同章和公章在法律效力上存在一些差异：
使用范围
公章：适用范围广泛，可以用于合同、文件、通知、证明等各种公司事务，具有行政管理效力。
合同章：只能在合同上使用，用于证明合同双方当事人对合同内容的确认和承诺，具有合同法律效力。
执章人
公章：一般由公司的法定代表人执掌，如果同时使用法定代表人章和公章，则代表公司行为。
合同章：可由法人执掌，也可由专门的合同人员负责保管。
管理部门
公章：管理部门多为公司的综合管理部门，负责维护公司的整体利益和形象。
合同章：管理部门一般为法律部门，以确保其在合同签订过程中的合法性和规范性。
法律效力
公章：在所有印章中具有最高的法律效力，是判断民事活动是否成立和生效的重要标准。在司法实践中，审查是否盖有法人公章是判断合同是否有效的重要依据。
合同章：虽然在合同事项上具有法律效力，但在其他场合下可能无法替代公章的作用。合同章的使用可以有效防止合同不经法律审查就直接对外签订生效问题的出现，有助于建立和完善合同避险制度。
建议
使用公章时：应确保公章的真实性和合法性，避免使用伪造或未经备案的公章，以保障合同的法律效力。
使用合同章时：应严格按照合同约定的用途使用，确保合同章的合法性和规范性。
管理印章时：公司应建立健全的印章管理制度，明确印章的使用范围、执章人和管理部门，防止印章被滥用或遗失。
通过以上措施，可以有效保障合同章和公章在商业活动中的法律效力，维护公司的合法权益。