城镇土地使用税的计税依据是 纳税人实际占用的土地面积。具体计算方式如下：
基本计算公式 ：全年应纳税额 = 实际占用应税土地面积（平方米）× 适用税额。地下建筑用地的税额计算公式：
全年应纳税额 = 证书确认应税土地面积或地下建筑物垂直投影面积（平方米）× 适用税额 × 50%。
土地面积确定方法
由省、自治区、直辖市人民政府确定的单位组织测定的土地面积为准。
持有政府部门核发的土地使用证书的，以证书确认的土地面积为准。
尚未核发土地使用证书的，纳税人应据实申报土地面积，待核发土地使用证书后再作调整。
特殊规定
对在城镇土地使用税征税范围内单独建造的地下建筑用地，按规定征收城镇土地使用税。已取得地下土地使用权证的，按土地使用权证确认的土地面积计算应征税款；未取得地下土地使用权证或地下土地使用权证上未标明土地面积的，按地下建筑垂直投影面积计算应征税款。上述地下建筑用地暂按应征税款的50%征收城镇土地使用税，但地上地下相连的建筑用地不执行此规定。
综上所述，城镇土地使用税的计税依据明确为纳税人实际占用的土地面积，并根据不同情况采用不同的计算方法。