亚种（subspecies）是指 某种生物分布在不同地区的种群，这些种群在形态构造或生理机能上因受所在地区生活环境的影响而发生了某些变化，从而在分类学上与该种的其他种群不同。亚种是次于种的一个种级分类等级，为国际动物命名法规所承认的最低分类等级。
亚种的形成通常是由于地理隔离导致生殖隔离，使得原本属于同一物种的不同种群在遗传上逐渐产生差异，最终可能发展成为新的物种。亚种可以根据其形成的原因和特征分为地理亚种和年代亚种。地理亚种是由于不同地区的环境条件导致的形态或生理差异，而年代亚种则是由于不同地质时代分布差异导致的形态特征差异。
需要注意的是，亚种并不是种内的不同变种或生态型，它们在遗传上具有一定的连续性，并且存在明确的地理分布界线。亚种名通常由三部分组成，即属名、种加词和亚种加词。
举个例子，北美灰狼和家犬可以被认为是灰狼的不同亚种，因为它们在形态特征和遗传上存在明显差异，但它们仍然能够交配繁殖并产生可育的后代。而黄种人和白种人则是一种文化概念，并非生物学上的亚种，因为它们在生物学上并没有明确的遗传隔离和形态差异。