公司个人所得税的计算遵循《中华人民共和国个人所得税法》及其相关法规。以下是个人所得税的税率和计算方式：
综合所得：
适用3%至45%的超额累进税率。
经营所得：
适用5%至35%的超额累进税率。
其他所得：
如利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，税率为20%。
工资薪金所得：
起征点为每月5000元，超过部分适用不同税率，具体如下：
不超过3000元，税率为3%，速算扣除数为0。
超过3000元至12000元，税率为10%，速算扣除数为210。
超过12000元至25000元，税率为20%，速算扣除数为1410。
以此类推，直至超过96万元的部分，税率为45%，速算扣除数为15160。
计算公式为：
```
应纳税额 = （工资薪金所得 - 起征点 - 专项扣除 - 专项附加扣除 - 依法确定的其他扣除 - 符合条件的公益慈善事业捐赠）× 适用税率 - 速算扣除数
```
例如，如果一个员工的月收入为10000元，扣除“五险一金”和其他允许扣除的项目后，应纳税所得额为6000元，则其应缴纳的个人所得税计算如下：
```
应纳税额 = （6000元 × 10% - 2520元） = 3480元 × 10% - 252元 = 348元 - 252元 = 96元
```
因此，该员工应缴纳的个人所得税为96元。
请注意，税法可能会有更新和变化，具体计算时应参考最新的税法规定和相关公告