运输公司租赁发票的税率根据纳税人类型不同而有所区别：
一般纳税人
增值税税率为17%。
不动产租赁服务的税率为11%。
小规模纳税人
增值税征收率为3%。
建议
运输公司在开具租赁发票时，应根据自身的纳税人身份选择正确的税率。
一般纳税人应使用17%的税率，而小规模纳税人则应使用3%的税率。
若同时提供有形动产租赁和不动产租赁服务，应分别核算不同税率的销售额，未分别核算的销售额从高适用税率。
这些税率适用于提供交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务的纳税人，销售不动产，转让土地使用权，以及提供有形动产租赁服务的纳税人。