购买公司后可能面临的麻烦主要包括以下几个方面：
股权瑕疵
出资不实：包括未出资、出资不足、抽逃出资、虚假出资等。如果买方对此明知，需向公司补足，或与卖方共同对债权人承担连带赔偿责任。出资不实还会导致股东权利受损，如表决权、分红权。
权利瑕疵：包括股权质押、司法查封、代持股权等。如果买方未尽到合理注意义务，将不适用善意取得制度，最终导致股权无法变更或无法购买而遭受损失。
资产不实
有形资产无权证：如房屋、土地权证不真实或被查封。
无形资产被高估：如专利权即将到期或已过期，商标过高估价。
虚构债权：隐瞒实际存在的债务。
隐瞒坏账：未披露的坏账会影响公司的财务状况。
潜在债务
对外担保：公司可能为其他公司提供担保，这些担保在未来可能成为真实债务。
未了结诉讼：公司可能涉及未解决的诉讼，这些诉讼可能导致未来的赔偿责任。
未履行合同：公司可能未履行某些合同义务，导致违约赔偿。
商标专利侵权：可能涉及侵犯他人商标或专利权，需要承担法律责任。
产品质量不合格：如果公司产品存在质量问题，需要承担相应的赔偿责任。
用工不合规：可能涉及违反劳动法规，导致行政处罚或赔偿。
环保未达标：可能因环保问题受到处罚。
税款未清缴：公司可能存在未清缴的税款，需要补缴税款及滞纳金。
非法融资：公司可能涉及非法融资活动，需要承担相应的法律责任。
信誉问题
银行信誉：公司如果在银行、税务、工商等部门有不良记录，会影响后续的金融业务。
社会信誉：公司的社会信誉会影响与其他业务伙伴的合作关系，可能导致合作困难或需要预付大量资金。
法律责任
行政责任：法定代表人可能因公司超出经营范围经营、隐瞒真实情况等受到行政处分或罚款。
民事责任：法定代表人因执行职务造成他人损害，需承担相应的民事赔偿责任。
刑事责任：如果公司构成单位犯罪，法定代表人作为直接负责的主管人员或其他直接责任人员，需承担刑事责任。
未尽事宜
民间借贷：公司与个人之间的民间借贷可能未在尽调中披露，给收购带来不可预计的风险。
劳动纠纷：公司可能与原员工存在劳动纠纷，这些问题在收购后可能爆发，导致额外的法律和经济负担。
建议
在购买公司之前，建议进行全面的尽职调查，包括但不限于财务审计、法律尽职调查、市场调研和信誉调查。通过这些调查可以尽可能发现并评估潜在的风险，从而制定相应的风险应对策略，降低收购后可能出现的麻烦。此外，建议在收购协议中明确转让前后的权责划分，以形成法律保护。