物流公司的纳税情况如下：
营业税
物流公司属于交通运输业，主税为营业税，税率为3%。
增值税
物流公司作为增值税的一般纳税人，提供运输服务时适用的税率为9%。
小规模纳税人的增值税征收率为3%。
附加税
城建税和教育费附加一般要交纳，分别为实际交营业税的10%。
地方教育费附加为增值税的2%。
个人所得税
独资企业或合伙企业需交纳个人所得税，按实际应税所得和适用税率计算。
公司制企业需交纳企业所得税，按实际应税所得计算。
其他税种
印花税、房产税、土地使用税等，具体税率和计算方法需参照相关税法规定。
建议
一般纳税人：若物流公司为一般纳税人，适用9%的增值税税率，并且可以抵扣进项税额（如运输费用发票的11%扣除率）。
小规模纳税人：若物流公司为小规模纳税人，适用3%的增值税征收率，且不能抵扣进项税额。
请根据公司的具体情况选择合适的税率和税种进行申报和缴纳税款。