公司应保留的存款金额取决于多个因素，包括企业的规模、业务需求、资金流动性需求以及未来的发展规划。以下是一些常见的建议：
最佳现金余额
根据企业的经营发展规划，最佳现金余额通常在5%至10%之间，但这只是一个大致的参考范围，具体数额需要根据企业的实际情况来确定。
库存现金
库存现金应有一个合理的核定数，如果单位距离银行较近且现金报销流量不频繁，一般建议保留5000至10000元之间的现金。
定期存款
单位定期留存金额最低为人民币一万元（或等值外币），须一次性存入。定期存款的期限和利率可以根据企业的需要选择。
通知存款
单位通知存款的起存金额为50万元，最低支取金额为10万元，适用于需要较高流动性和灵活性的资金。
货币资金存量
企业保留的库存现金和银行存款（即货币资金存量）应保持在一个既能保障日常支付又不影响资产盈利能力的水平。一般建议将多余的现金存入银行，以减少账面现金并提高资金的使用效率。
具体操作
有些公司可能会将多余的现金以其他应收款的形式存放，待企业有多余资金后再存入银行，或者通过增加发票支出将账面现金变为费用支出。
综合以上建议，公司应根据自身的实际情况和需求，合理确定存款金额。对于一般企业，建议保持一定的现金库存以应对日常支出和应急情况，并将多余资金存入银行以保障资金的安全性和流动性。同时，定期存款和通知存款可以作为资金管理的补充手段，以满足不同期限和流动性需求。