货代公司的佣金情况如下：
船东给订舱代理的佣金：
一般在2.5%-4.25%之间。
货代给客户的回扣：
这种回扣是不合法的，但在实际操作中，由于市场竞争激烈，货代公司往往会提供回扣以吸引客户，具体比例不固定，但通常较高，有时甚至可以达到5倍于佣金。
货运代理的佣金占运费的百分比：
通常在1%到5%之间。
纯利润与提成的关系：
提成一般按纯利润计算，纯利润越多，提成比例越高，一般在20%-50%不等。
综上所述，货代公司的佣金情况较为复杂，具体比例因公司、业务类型、市场竞争等因素而异。订舱代理的佣金相对较为固定，而给客户的回扣则因公司策略不同而有所差异。货运代理的佣金占运费的比例通常在1%到5%之间。
建议在实际操作中，货代公司应根据自身情况和市场需求合理设定佣金比例，并确保合法合规经营。