公司发工资时扣除的公积金金额取决于多个因素，包括个人的工资基数以及公司和员工个人选择的公积金缴存比例。根据国务院《住房公积金管理条例》的规定，公积金的缴纳比例是员工工资基数的5%-12%。
具体计算方式如下：
确定公积金缴纳基数：
这通常是员工上一年度的平均工资。
计算个人和单位应缴公积金：
个人和单位各自按照工资基数乘以公积金缴存比例来计算应缴金额。例如，如果公积金缴纳比例为12%，且员工工资为10000元，则个人和单位各自需缴纳1200元，合计2400元。
因此，公司发工资时扣除的公积金金额大致在员工工资基数的5%至12%之间。一些单位可能会根据实际情况对缴存比例进行调整，但最低缴存比例不得低于5%，最高缴存比例不得超过12%。
建议在签订劳动合同时，详细询问并了解公司为您缴纳的公积金比例和基数，以便更好地规划个人财务。