公司补税的计算方法如下：
补缴企业所得税的计算公式
补缴企业所得税的补缴额 = （收入总额 - 不征税收入 - 免税收入 - 各项扣除金额 - 允许弥补的以前年度亏损） × 适用税率 - 已缴纳的企业所得税税额。
补缴个人所得税的计算方法
应退或应补税额 = [（综合所得收入额 - 60000元 - “三险一金”等专项扣除 - 子女教育等专项附加扣除 - 依法确定的其他扣除 - 符合条件的公益慈善事业捐赠） × 适用税率 - 速算扣除数] - 已预缴税额。
补缴增值税的计算方法
实际补缴增值税时：借：应交税金-未交增值税 贷：银行存款。
建议
详细核对账目：在补缴税款前，企业应仔细核对账目，确保所有收入和扣除项目均符合税法规定，避免因计算错误导致补税金额不准确。
及时咨询税务机关：若对补缴税款的具体操作或计算方法有疑问，应及时咨询当地税务机关或专业税务顾问，以确保补缴过程顺利进行。
保存相关文件：补缴税款后，应妥善保存所有相关文件，如补税申报表、缴款证明等，以备日后查验。